Lynn Margulis propôs um sistema de classificação, que no essencial mantêm os reinos criados por Whittaker ( Reino Monera, Reino Protista, Reino Fungi, Reino Plantae, Reino Animalia), sugerindo a criação de dois grupos taxonómicos hierarquicamente superiores ao reino, que designou por super-reino ou domínio, que são o Prokarya e o Eukarya.
Para além disso, propôs a divisão do Reino Monera em dois sub-reinos - o Archaea(Arqueobactérias) e o Eubacteria (Eubactérias), este nao estão representados na imagem a baixo.
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